庆应三年——幕末动乱时代。
由于将军德川庆喜的大政奉还，江户幕府濒临解体，幕府与讨幕派的对立日渐激化。近藤勇、土方岁三率领的新撰组，在经历油小路事件后遭受重创，即使如此仍然决定向庆喜效忠。
此时，皇帝向萨摩藩、长州藩下达了讨幕的密敕，并紧接着颁布了王政复古的大号令。朝廷宣告了德川幕府的终结。对此承诺的庆喜移居大阪，新撰组也再一次以并非“浪士集团”而是“幕臣”的身份备战，将屯所移至伏见奉行所。
新撰组队士·市村铁之助，怀着对从以前开始就关系亲密的少女·沙夜的思念，以副长·土方岁三小姓的身份，与身为队医的好友山崎烝、兄长辰之助一起，准备共同迎来身为新撰组一员的命运，但……。
期盼成为武士而前往京都的年轻人们，为了能够衣锦还乡而向着战斗突进。即使最终迎来的会是悲伤的别离……。
当幕末的风云在屏幕上翻涌，市村铁之助的故事像一把生锈的刀，剖开了理想与现实的血肉。这个十五岁少年冲向新撰组大门的背影，裹挟着复仇的怒火与生存的渴望，却在时代的齿轮下被碾得支离破碎。导演用近乎残忍的温柔，将“想道”二字拆解成无数个潮湿的清晨与血色的黄昏——那些关于武士梦的执念，原来不过是乱世中飘摇的纸灯笼。
冲田总司咳血时染红帕子的指尖，土方岁三擦拭佩刀时颤抖的睫毛，近藤勇拥抱铁之助时铠甲下的体温，这些细节像暗夜里的萤火，照亮了历史褶皱里的人味。当镜头掠过沙夜捧着饭团等待的身影，山崎烝背着药箱奔走的泥脚印，辰之助为弟弟缝补衣领的粗线脚，突然惊觉所谓“武士之道”，不过是困兽们用忠诚编织的牢笼。铁之助挥刀砍向稻草人的每一声闷响，都在叩问着：当私仇撞上大义，少年眼中的光该投向何处？
影片最刺骨的不是刀剑相撞的铿锵，而是庆应三年的雨一直下。铁之助躲在檐下看队士们互道珍重，沙夜的信被雨水晕成墨团，冲田总司的咳嗽声混着远处的炮响。当他终于握住土方递来的刀柄，却发现自己握不住命运的缰绳。那些以为能斩断黑暗的利刃，最终割裂的只是自己单纯的幻梦。导演用蒙太奇手法将成长撕裂成碎片：兄长为他挡箭时的笑靥，冲田临终前未送出的糖果，斋藤一刀刃上的反光，都成了少年心中永不结痂的伤疤。
剧场版像是一首提前写就的挽歌，每个音符都在诉说着失去。当片尾曲响起时，忽然明白“想道”不是通向未来的道路，而是回望来处的目光。那些倒在黎明前的魂魄，用鲜血浇灌出的樱花，终究开在了铁之助永远抵达不了的春天。幕布落下时，听见历史的风穿过发梢的声音，带着咸涩的水汽和铁锈味的叹息。